El Club Atlético Villa Nueva nace en Puerto Iguazú como equipo de fútbol primeramente en el año 1964, cuando un grupo de vecinos y amigos del barrio Villa Nueva se unen para participar en el torneo organizado por la Liga de Deportes Iguazú, que fuera creada el 22 de agosto de 1953.

En esos días, Puerto Iguazú distaba mucho de ser lo que es actualmente. Era una comunidad pequeña de unos tres mil habitantes aproximadamente, y su administración pública era todavía una Comisión de Fomento, que tenía como intendente a doña Ángela Filippini, quien resultó ser una de las primeras alcaldesas del país, que entonces tenía como presidente a Arturo Umberto Illia, y en la incipiente Provincia de Misiones gobernaba Mario Losada.  

Fue también en esa década (1960 – 70) que el acceso a la ciudad de Puerto Iguazú comenzaba a ser más frecuente “por tierra”, pues hasta entonces a Iguazú se llegaba mayormente por río. La Ruta Nacional N° 12 comenzó a mejorar y expandir, facilitando que más personas llegasen a conocer la Maravilla Natural o instalarse en la comunidad utilizando ese camino.

En ese contexto, en el barrio Villa Nueva, ubicado a metros de la confluencia de los ríos Paraná e Iguazú y el Hito Tres Fronteras, nace formalmente el equipo de fútbol, que estaba compuesto por vecinos que todas las tardes se juntaban a jugar a la pelota en el centro neurálgico del barrio que era “la cancha”, el lugar de encuentro, actualmente la Plaza Manuel Belgrano, ubicada entre la Avenida 9 de Julio y Urquiza del barrio Villa Nueva.

Así fue que después de esa primera experiencia en el torneo de 1964, Villa Nueva sale campeón en el torneo del año 1965, siendo el primero en nuestro haber de la categoría Primera División, para continuar sumando trofeos a nuestra vitrina, participando en los campeonatos de la liga de Iguazú y en la provincia.

Con el paso del tiempo, la Liga de Deportes se transformó en la Liga Regional de Fútbol de Iguazú, afiliándose a la Asociación de Fútbol Argentino (AFA), más precisamente en el año 1984, y nuestro club siguiendo los pasos del desarrollo deportivo, también se organizó para transformarse de un equipo de fútbol a un club atlético.

La reunión para conformar la primera Comisión Directiva y de esta manera poder lograr la Personería Jurídica, se llevó a cabo el 1 de abril de 1984 en la residencia de Juan Félix Cáceres, quien fue el encargado de presentar ante los presentes las intenciones y objetivos del futuro club. Allí, por unanimidad, luego de las deliberaciones, siendo exactamente las 11hs, se crea oficialmente el Club Atlético Villa Nueva, que pasó a tener la primera Comisión Directiva.